Difference between revisions of "Paper"

From SubtiWiki
Jump to: navigation, search
(→‎Daniel Reuß)
(→‎not yet in SubtiWiki)
 
(602 intermediate revisions by 5 users not shown)
Line 1: Line 1:
−
==Daniel Reuß==
+
* strongly repressed in response to glucose starvation in M9 medium {{PubMed|23033921}}: [[hupA]] [[cycC]]  
−
Schmidl et al: PLOS Pathogens
 
−
<pubmed>21546586 10066529</pubmed>
 
−
 
 
−
* [[Mbl]]
 
−
[[KinC]]
 
−
[[PdhB]][[PdhA]]
 
−
[[PdhC]]
 
−
[[PdhD]]
 
−
[[OdhA]]
 
−
[[OdhB]]
 
−
[[YlaD]]
 
−
[[Sco]][[CtaC]]
 
−
* 
 
−
[[StoA]][[SpoVD]]
 
−
[[SpoVE]]
 
−
[[FtsA]]
 
−
[[ZapA]]
 
−
[[EzrA]]
 
−
[[MciZ]]
 
−
[[SepF]]
 
−
[[SpoIIGA]]
 
−
[[MinC]][[DivIVA]]
 
−
[[MinD]]
 
−
[[MinJ]]
 
−
[[RacA]]
 
−
* [[SpoIVA]][[SpoVM]]
 
−
[[SpoVID]][[FapR]]
 
−
[[PlsY]][[PlsX]]
 
−
[[ScpA]][[Smc]]
 
−
[[ScpB]]
 
−
[[Ffh]]
 
−
[[Scr]]
 
−
[[SucC]]
 
−
[[SucD]]
 
−
[[RecA]][[DprA]]
 
−
[[ClpY]][[ClpQ]]
 
−
[[EpsE]][[FliG]]
 
−
[[FlhA]][[FliJ]]
 
−
[[FliT]]
 
−
* CheC CheY
 
−
CheA
 
−
FliD FlhA
 
−
Hag
 
−
FliS
 
−
McpB  CheA 
 
−
CheC
 
−
McpB
 
−
CheD
 
−
FlgM
 
−
RecU RecA
 
−
CotC CotE
 
−
CotU
 
−
EbrA EbrB
 
−
NrdF NrdE
 
−
GlnR
 
−
* CotC  CotU 
 
−
CitG
 
−
YngE YngH
 
−
Icd
 
−
PhrK RapK
 
−
SdpC CsaA
 
−
DesR DesK
 
−
OdhA OdhB
 
−
Icd
 
−
YplP
 
−
ThyB DfrA
 
−
EzrA UgtP
 
−
TrpB  TrpA 
 
−
CarB CarA
 
−
* SpoVID
 
−
SafA SpoIVA
 
−
Fer
 
−
RsiX
 
−
ResD ResE
 
−
ResB ResC
 
−
ScpA ScpB
 
−
RibE RibH
 
−
SpoIIAA
 
−
SpoIIP SpoIIM
 
−
BkdR
 
−
Spo0B
 
−
* BofC 
 
−
AccA AccC
 
−
AccD
 
−
AccB
 
−
SpoIIQ  SpoIIIAH 
 
−
SpoIIIJ SpoIIIAE
 
−
SinI
 
−
SlrA
 
−
SlrR PbpA
 
−
GlyQ GlyS
 
−
* DnaK DnaJ
 
−
SpoIID SpoIIP
 
−
KinB
 
−
SpoIVFB
 
−
TrxA  ArsC  YqaM
 
−
SpoIIIC
 
−
YrkP YrkQ
 
−
RsiV
 
−
* SpoVID SafA
 
−
Spo0B MinC MinD
 
−
MinJ
 
−
MreD
 
−
Mbl
 
−
ClpX
 
−
SdhA SdhB 
 
−
SdhC
 
−
UvrB UvrC
 
−
* PheS PheT
 
−
* LytS LytT
 
−
PhoP  PhoR 
 
−
CitZ
 
−
Icd
 
−
CitG
 
−
AccD AccA
 
−
MotP MotS
 
−
* BceR BceS
 
−
KtrB KtrA
 
−
KinB PbpD
 
−
MalR MalK
 
−
MrpB MrpA
 
−
MrpC
 
−
MrpD
 
−
MrpE
 
−
MrpF
 
−
MrpG
 
−
* RapF 
 
−
ComP
 
−
RapD
 
−
RapK
 
−
DegS DegQ
 
−
IscU SufU
 
−
SufS
 
−
CssS CssR
 
−
LiaS LiaR
 
−
YvrG
 
−
* CopZ CopA
 
−
SdpR SdpI
 
−
YkzW
 
−
YvfT YvfU
 
−
RsbQ
 
−
AcoR
 
−
RocR
 
−
EpsA EpsB
 
−
SlrA SlrR
 
−
PsdS PsdR
 
−
UvrB 
 
−
* FliD FliT
 
−
FliS
 
−
RsmY CsrA
 
−
RapG DegU
 
−
CotG CotB
 
−
YwrA YwrB
 
−
TkmA
 
−
PtpZ
 
−
Ugd
 
−
* TuaD
 
−
Ssb
 
−
SsbB
 
−
Ldh
 
−
YvyG
 
−
YnfE
 
−
Asd
 
−
YorK
 
−
RapB
 
−
* RapE 
 
−
PhrE
 
−
PhrF RapF
 
−
LicC
 
−
*YxjL YxjM
 
−
YxdJ YxdK
 
−
* PhrG RapG
 
−
YycH YycI
 
−
WalR WalK   
 
−
ThdF GidA
 
−
RnpA
 
−
RnpB
 
−
GmuC
 
−
* SbcC 
 
−
RecG
 
−
YrvE
 
−
YrvN 
 
−
RecO
 
−
YqiB
 
−
Ung
 
−
YpbB
 
−
YrrC
 
−
* YycH WalK
 
−
YycI
 
−
CheB CheA
 
−
CheV
 
−
Tkt Tpi
 
−
SpoIISB SpoIISA
 
−
Soj Spo0J
 
−
YirB
 
−
RsbRB   
 
−
* RsbRC
 
−
GerAB GerAA
 
−
GerAC
 
−
ComGB ComGA
 
−
ComFA
 
−
ComGC
 
−
ComGD
 
−
ComGE
 
−
ComGG
 
−
ComGC ComC
 
−
ComGD
 
−
* ComGE
 
−
ComGG
 
−
ComGA ComEC
 
−
ComEA 
 
−
ComFA
 
−
CoiA
 
−
SsbB
 
−
DprA
 
−
RecA
 
−
CoiA SsbB
 
−
DprA
 
−
RecA
 
−
* TasA TapA
 
−
UreC DivIVA Maf
 
−
FtsW
 
−
RuvB RuvA
 
−
RecU
 
−
GerAC Lgt
 
−
GerBC GerBA
 
−
GerBB
 
−
GerKC GerKB
 
−
GerKC
 
−
GerKA
 
−
fer des
 
−
Fra SufU
 
−
RnpA
 
−
* CitT CitS
 
−
NdoA NdoAI
 
−
SpoIIQ SpoIIE
 
−
CymR CysK
 
−
PabA PabB
 
−
TrpE
 
−
* McsA CtsR
 
−
McsB
 
−
YpbH
 
−
RacA DisA
 
  
−
==not yet in SubtiWiki==
+
==not yet in SubtiWiki==  
−
<pubmed> 21636651</pubmed>
+
<pubmed>31239381  31237868
−
{{PubMed|}}
+
  31235516
−
===sonst (nur Excel-Liste)===
+
    31134210    31197963 31160399 31066113
 +
    31199835  31217292 </pubmed>
  
−
==POTM==
+
==POTM 2018==
−
* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21749987 Chi ''et al''.] demonstrate that S-bacillithiolation of the repressor [[OhrR]] and of four enzymes of the methionine biosynthesis pathway protects the ''B. subtilis'' cell against hypochlorite stress.
+
<pubmed>    </pubmed>
−
<pubmed>21749987</pubmed>
+
 
−
* '''Relevant ''Subti''Wiki pages:'''  [[Haike Antelmann]], [[Dörte Becher]], [[Ulrike Mäder]], [[resistance against oxidative and electrophile stress]], [[Spx regulon]], [[CtsR regulon]], [[PerR regulon]], [[OhrR]], [[MetE]], [[YxjG]], [[PpaC]], [[SerA]], [[YphP]]
+
== für Master-Seminar ==
 +
<pubmed>   24529384    20431016    24097941    22773139    21127214</pubmed>

Latest revision as of 10:09, 6 April 2020

  • strongly repressed in response to glucose starvation in M9 medium PubMed: hupA cycC

not yet in SubtiWiki

Nikolai P Radzinski, Marina Besprozvannaya, Eric L McLean, Anusha Talwalkar, Briana M Burton
DNA-Membrane Anchor Facilitates Efficient Chromosome Translocation at a Distance in Bacillus subtilis.
mBio: 2019, 10(3);
[PubMed:31239381] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Katherine R Hummels, Daniel B Kearns
Suppressor mutations in ribosomal proteins and FliY restore Bacillus subtilis swarming motility in the absence of EF-P.
PLoS Genet: 2019, 15(6);e1008179
[PubMed:31237868] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Bentley Shuster, Mark Khemmani, Yusei Nakaya, Gudrun Holland, Keito Iwamoto, Kimihiro Abe, Daisuke Imamura, Nina Maryn, Adam Driks, Tsutomu Sato, Patrick Eichenberger
Expansion of the Spore Surface Polysaccharide Layer in Bacillus subtilis by Deletion of Genes Encoding Glycosyltransferases and Glucose Modification Enzymes.
J Bacteriol: 2019, 201(19);
[PubMed:31235516] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Sofia Arnaouteli, D A Matoz-Fernandez, Michael Porter, Margarita Kalamara, James Abbott, Cait E MacPhee, Fordyce A Davidson, Nicola R Stanley-Wall
##Title##
Proc Natl Acad Sci U S A: 2019, 116(27);13553-13562
[PubMed:31217292] [WorldCat.org] [DOI] (I p)

Cameron V Sayer, Bidisha Barat, David L Popham
Identification of L-Valine-initiated-germination-active genes in Bacillus subtilis using Tn-seq.
PLoS One: 2019, 14(6);e0218220
[PubMed:31199835] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Seoungjun Lee, Ling Juan Wu, Jeff Errington
Microfluidic time-lapse analysis and reevaluation of the Bacillus subtilis cell cycle.
Microbiologyopen: 2019, 8(10);e876
[PubMed:31197963] [WorldCat.org] [DOI] (I p)

Emily E Brown, Allyssa K Miller, Inna V Krieger, Ryan M Otto, James C Sacchettini, Jennifer K Herman
##Title##
J Bacteriol: 2019, 201(16);
[PubMed:31160399] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Björn Richts, Jonathan Rosenberg, Fabian M Commichau
##Title##
Front Mol Biosci: 2019, 6;32
[PubMed:31134210] [WorldCat.org] [DOI] (P e)

Natalí B Rasetto, Antonela Lavatelli, Natalia Martin, María Cecilia Mansilla
Unravelling the lipoyl-relay of exogenous lipoate utilization in Bacillus subtilis.
Mol Microbiol: 2019, 112(1);302-316
[PubMed:31066113] [WorldCat.org] [DOI] (I p)


POTM 2018


für Master-Seminar