Difference between revisions of "Paper"

From SubtiWiki
Jump to: navigation, search
(→‎Daniel Reuß)
(→‎not yet in SubtiWiki)
 
(604 intermediate revisions by 5 users not shown)
Line 1: Line 1:
−
==Daniel Reuß==
+
* strongly repressed in response to glucose starvation in M9 medium {{PubMed|23033921}}: [[hupA]] [[cycC]]  
−
Schmidl et al: PLOS Pathogens
 
−
<pubmed>21546586 10066529</pubmed>
 
−
 
 
−
* [[BioI]]
 
−
[[DppC]][[DppB]]
 
−
[[DppD]]
 
−
[[YkfD]]
 
−
[[DppE]]
 
−
[[OppC]][[OppB]]
 
−
[[OppD]]
 
−
[[OppF]]
 
−
[[OppA]]
 
−
[[AppF]][[AppD]]
 
−
[[AppB]]
 
−
[[AppC]]
 
−
[[AppA]]
 
−
[[GlnQ]][[GlnP]]
 
−
[[GlnM]]
 
−
[[GlnH]]
 
−
[[TcyM]][[TcyL]]
 
−
[[TcyJ]]
 
−
[[TcyK]]
 
−
[[TcyN]]
 
−
[[YurN]][[YurM]]
 
−
[[YurJ]]
 
−
[[YurO]]
 
−
* OpuBD OpuBB
 
−
OpuBA
 
−
OpuBC
 
−
OpuCA OpuCB
 
−
OpuCC
 
−
OpuCD
 
−
TcyA TcyB
 
−
TcyC
 
−
ArtP ArtQ
 
−
ArtR
 
−
YxeM YxeN
 
−
YxeO
 
−
YckB Ycka
 
−
YknV YknU
 
−
YknZ  YknY 
 
−
* Mbl
 
−
KinC
 
−
PdhB PdhA
 
−
PdhC
 
−
PdhD
 
−
OdhA
 
−
OdhB
 
−
YlaD
 
−
Sco CtaC
 
−
* 
 
−
StoA SpoVD
 
−
SpoVE
 
−
FtsA
 
−
ZapA
 
−
EzrA
 
−
MciZ
 
−
SepF
 
−
SpoIIGA
 
−
MinC DivIVA
 
−
MinD
 
−
MinJ
 
−
RacA
 
−
* SpoIVA  SpoVM 
 
−
SpoVID FapR
 
−
PlsY PlsX
 
−
BioI 
 
−
ScpA Smc
 
−
ScpB
 
−
Ffh
 
−
Scr
 
−
SucC
 
−
SucD
 
−
RecA DprA
 
−
ClpY ClpQ
 
−
EpsE FliG
 
−
FlhA FliJ
 
−
FliT
 
−
* CheC CheY
 
−
CheA
 
−
FliD FlhA
 
−
Hag
 
−
FliS
 
−
McpB  CheA 
 
−
CheC
 
−
McpB
 
−
CheD
 
−
FlgM
 
−
RecU RecA
 
−
CotC CotE
 
−
CotU
 
−
EbrA EbrB
 
−
NrdF NrdE
 
−
GlnR
 
−
* CotC  CotU 
 
−
CitG
 
−
YngE YngH
 
−
Icd
 
−
PhrK RapK
 
−
SdpC CsaA
 
−
DesR DesK
 
−
OdhA OdhB
 
−
Icd
 
−
YplP
 
−
ThyB DfrA
 
−
EzrA UgtP
 
−
TrpB  TrpA 
 
−
CarB CarA
 
−
* SpoVID
 
−
SafA SpoIVA
 
−
Fer
 
−
RsiX
 
−
ResD ResE
 
−
ResB ResC
 
−
ScpA ScpB
 
−
RibE RibH
 
−
SpoIIAA
 
−
SpoIIP SpoIIM
 
−
BkdR
 
−
Spo0B
 
−
* BofC 
 
−
AccA AccC
 
−
AccD
 
−
AccB
 
−
SpoIIQ  SpoIIIAH 
 
−
SpoIIIJ SpoIIIAE
 
−
SinI
 
−
SlrA
 
−
SlrR PbpA
 
−
GlyQ GlyS
 
−
* DnaK DnaJ
 
−
SpoIID SpoIIP
 
−
KinB
 
−
SpoIVFB
 
−
TrxA  ArsC  YqaM
 
−
SpoIIIC
 
−
YrkP YrkQ
 
−
RsiV
 
−
* SpoVID SafA
 
−
Spo0B
 
  
−
MinC MinD
+
==not yet in SubtiWiki==
−
MinJ
+
<pubmed>31239381  31237868
−
MreD
+
  31235516
−
Mbl
+
    31134210    31197963 31160399 31066113
−
ClpX
+
    31199835 31217292 </pubmed>
−
SdhA SdhB 
 
−
SdhC
 
−
UvrB UvrC
 
−
* PheS PheT
 
−
OpuAA OpuAB
 
−
OpuAC
 
−
SsuA SsuC
 
−
SsuB
 
−
YtlC YtlD
 
−
YtlA
 
−
* YvrA YvrB
 
−
YvrC
 
−
YcdH YceA
 
−
YcdI
 
−
YjkB YjkA
 
−
YvgM YvgL
 
−
AraN AraQ
 
−
AraP
 
−
* LytS LytT
 
−
PhoP  PhoR 
 
−
CitZ
 
−
Icd
 
−
CitG
 
−
AccD AccA
 
−
MotP MotS
 
−
YthP YthQ
 
−
* BceA BceB
 
−
BceR BceS
 
−
YtrB YtrF
 
−
YtrE
 
−
YtrC
 
−
YtrD
 
−
KtrB KtrA
 
−
KinB PbpD
 
−
MalR MalK
 
−
MrpB MrpA
 
−
MrpC
 
−
MrpD
 
−
MrpE
 
−
MrpF
 
−
MrpG
 
−
* RapF 
 
−
ComP
 
−
RapD
 
−
RapK
 
−
DegS DegQ
 
−
IscU SufU
 
−
SufS
 
−
CssS CssR
 
−
LiaS LiaR
 
−
YvrG
 
−
YvrO YvrN
 
−
FhuB FhuC
 
−
FhuG
 
−
FhuD
 
−
YxeB
 
−
* CopZ CopA
 
−
SdpR SdpI
 
−
YkzW
 
−
YvfT YvfU
 
−
YvfR YvfS  RsbQ
 
−
AcoR
 
−
RocR
 
−
EpsA EpsB
 
−
SlrA SlrR
 
−
PsdB PsdA
 
−
PsdS PsdR
 
−
UvrB 
 
−
* FtsE FtsX
 
−
FliD FliT
 
−
FliS
 
−
RsmY CsrA
 
−
RapG DegU
 
−
TagG  TagH 
 
−
CotG CotB
 
−
YwrA YwrB
 
−
TkmA
 
−
PtpZ
 
−
Ugd
 
−
* TuaD
 
−
Ssb
 
−
SsbB
 
−
Ldh
 
−
YvyG
 
−
YnfE
 
−
Asd
 
−
YorK
 
−
RapB
 
−
* RbsD RbsC
 
−
RbsB
 
−
RbsA
 
−
RapE 
 
−
PhrE
 
−
AlbD AlbC
 
−
PhrF RapF
 
−
LicC
 
−
* YxlF YxlG
 
−
CydC CydD
 
−
YxjL YxjM
 
−
YxdL YxdM
 
−
YxdJ YxdK
 
−
YydI YydJ
 
−
YydH
 
−
* PhrG RapG
 
−
YycH YycI
 
−
WalR WalK   
 
−
YybJ YybL
 
−
YybK
 
−
ThdF GidA
 
−
RnpA
 
−
RnpB
 
−
GmuC
 
−
MetN MetP
 
−
MetQ
 
−
* SbcC  
 
−
RecG
 
−
YrvE
 
−
YrvN 
 
−
RecO
 
−
YqiB
 
−
Ung
 
−
YpbB
 
−
YrrC
 
−
* YycH WalK
 
−
YycI
 
−
CheB CheA
 
−
CheV
 
−
Tkt Tpi
 
−
SpoIISB SpoIISA
 
−
Soj Spo0J
 
−
BceS BceB
 
−
YirB
 
−
RsbRB   
 
−
* RsbRC
 
−
GerAB GerAA
 
−
GerAC
 
−
ComGB ComGA
 
−
ComFA
 
−
ComGC
 
−
ComGD
 
−
ComGE
 
−
ComGG
 
−
ComGC ComC
 
−
ComGD
 
−
* ComGE
 
−
ComGG
 
−
ComGA ComEC
 
−
ComEA 
 
−
ComFA
 
−
CoiA
 
−
SsbB
 
−
DprA
 
−
RecA
 
−
CoiA SsbB
 
−
DprA
 
−
RecA
 
−
* TasA TapA
 
−
UreC DivIVA Maf
 
−
FtsW
 
−
RuvB RuvA
 
−
RecU
 
−
GerAC Lgt
 
−
GerBC GerBA
 
−
GerBB
 
−
GerKC GerKB
 
−
GerKC
 
−
GerKA
 
−
fer des
 
−
Fra SufU
 
−
RnpA
 
−
* CitT CitS
 
−
NdoA NdoAI
 
−
SpoIIQ SpoIIE
 
−
CymR CysK
 
−
PabA PabB
 
−
TrpE
 
−
* McsA CtsR
 
−
McsB
 
−
YpbH
 
−
RacA DisA
 
  
−
==not yet in SubtiWiki==
+
==POTM 2018==
−
<pubmed> 21636651</pubmed>
+
<pubmed>     </pubmed>
−
{{PubMed|}}
 
−
===sonst (nur Excel-Liste)===
 
  
−
==POTM==
+
== für Master-Seminar ==
−
* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21749987 Chi ''et al''.] demonstrate that S-bacillithiolation of the repressor [[OhrR]] and of four enzymes of the methionine biosynthesis pathway protects the ''B. subtilis'' cell against hypochlorite stress.
+
<pubmed>   24529384    20431016    24097941    22773139    21127214</pubmed>
−
<pubmed>21749987</pubmed>
 
−
* '''Relevant ''Subti''Wiki pages:'''  [[Haike Antelmann]], [[Dörte Becher]], [[Ulrike Mäder]], [[resistance against oxidative and electrophile stress]], [[Spx regulon]], [[CtsR regulon]], [[PerR regulon]], [[OhrR]], [[MetE]], [[YxjG]], [[PpaC]], [[SerA]], [[YphP]]
 

Latest revision as of 10:09, 6 April 2020

  • strongly repressed in response to glucose starvation in M9 medium PubMed: hupA cycC

not yet in SubtiWiki

Nikolai P Radzinski, Marina Besprozvannaya, Eric L McLean, Anusha Talwalkar, Briana M Burton
DNA-Membrane Anchor Facilitates Efficient Chromosome Translocation at a Distance in Bacillus subtilis.
mBio: 2019, 10(3);
[PubMed:31239381] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Katherine R Hummels, Daniel B Kearns
Suppressor mutations in ribosomal proteins and FliY restore Bacillus subtilis swarming motility in the absence of EF-P.
PLoS Genet: 2019, 15(6);e1008179
[PubMed:31237868] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Bentley Shuster, Mark Khemmani, Yusei Nakaya, Gudrun Holland, Keito Iwamoto, Kimihiro Abe, Daisuke Imamura, Nina Maryn, Adam Driks, Tsutomu Sato, Patrick Eichenberger
Expansion of the Spore Surface Polysaccharide Layer in Bacillus subtilis by Deletion of Genes Encoding Glycosyltransferases and Glucose Modification Enzymes.
J Bacteriol: 2019, 201(19);
[PubMed:31235516] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Sofia Arnaouteli, D A Matoz-Fernandez, Michael Porter, Margarita Kalamara, James Abbott, Cait E MacPhee, Fordyce A Davidson, Nicola R Stanley-Wall
##Title##
Proc Natl Acad Sci U S A: 2019, 116(27);13553-13562
[PubMed:31217292] [WorldCat.org] [DOI] (I p)

Cameron V Sayer, Bidisha Barat, David L Popham
Identification of L-Valine-initiated-germination-active genes in Bacillus subtilis using Tn-seq.
PLoS One: 2019, 14(6);e0218220
[PubMed:31199835] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Seoungjun Lee, Ling Juan Wu, Jeff Errington
Microfluidic time-lapse analysis and reevaluation of the Bacillus subtilis cell cycle.
Microbiologyopen: 2019, 8(10);e876
[PubMed:31197963] [WorldCat.org] [DOI] (I p)

Emily E Brown, Allyssa K Miller, Inna V Krieger, Ryan M Otto, James C Sacchettini, Jennifer K Herman
##Title##
J Bacteriol: 2019, 201(16);
[PubMed:31160399] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Björn Richts, Jonathan Rosenberg, Fabian M Commichau
##Title##
Front Mol Biosci: 2019, 6;32
[PubMed:31134210] [WorldCat.org] [DOI] (P e)

Natalí B Rasetto, Antonela Lavatelli, Natalia Martin, María Cecilia Mansilla
Unravelling the lipoyl-relay of exogenous lipoate utilization in Bacillus subtilis.
Mol Microbiol: 2019, 112(1);302-316
[PubMed:31066113] [WorldCat.org] [DOI] (I p)


POTM 2018


für Master-Seminar