Difference between revisions of "Paper"

From SubtiWiki
Jump to: navigation, search
(→‎Daniel Reuß)
(→‎not yet in SubtiWiki)
 
(623 intermediate revisions by 5 users not shown)
Line 1: Line 1:
−
==Daniel Reuß==
+
* strongly repressed in response to glucose starvation in M9 medium {{PubMed|23033921}}: [[hupA]] [[cycC]]
−
Schmidl et al: PLOS Pathogens
 
−
<pubmed>21546586 10066529</pubmed>
 
  
−
* [[UreB]][[UreA]][[GyrA]][[GyrB]]
+
==not yet in SubtiWiki==
−
[[PdxT]] [[PdxS]]
+
<pubmed>31239381  31237868
−
[[YabA]] [[DnaN]]
+
  31235516
−
[[DnaD]] [[SpoIVB]] [[BofA]]
+
    31134210    31197963 31160399 31066113
−
[[CsfB]]
+
    31199835  31217292 </pubmed>
−
[[SirA]]
 
−
* [[YqaH]][[AbbA]]
 
−
[[Abh]]
 
−
[[Prs]][[PurR]]
 
−
[[UvrA]][[Mfd]]
 
−
[[FtsL]]DivIC
 
−
[[PbpB]]
 
−
* [[SecY]][[SecE]]
 
−
[[SecG]]
 
−
[[SecA]]
 
−
* [[YsxC]
 
−
[[DivIB]]
 
−
[[FtsZ]]
 
−
[[SpoIIAB]]
 
−
* [[MreB]][[TufA]]
 
−
YbaE
 
−
* YbaF YbxA
 
−
Obg
 
−
RsiW
 
−
PrsW
 
−
RasP
 
−
SkfF SkfE
 
−
YbdK YbdJ
 
−
GlnL GlnK
 
−
MtrB RtpA
 
−
YcbM YcbL
 
−
TatAD PhoD
 
−
TatCD
 
−
TatCY
 
−
* NatR  NatK 
 
−
NatB NatA
 
−
NasD NasE
 
−
NasB NasC
 
−
MecA ComS
 
−
YfmE YfmD
 
−
YfmC
 
−
YhfQ
 
−
YfmF
 
−
YclO YclN
 
−
YclP
 
−
YclQ
 
−
* YclI YclH
 
−
YclK YclJ
 
−
PhrC
 
−
ComA RapC
 
−
MtlR  MtlA 
 
−
MtlF
 
−
KinA KipI
 
−
KipA
 
−
PrsA PbpC
 
−
DctR DctS
 
−
* YdbK YdbJ
 
−
CspB
 
−
PnpA
 
−
RnjA
 
−
PfkA
 
−
AcpA AcpS
 
−
RsbT  RsbR 
 
−
RsbS
 
−
RsbX
 
−
RsbU
 
−
* RsbV
 
−
RsbW
 
−
RsbP
 
−
ImmA ImmR delete
 
−
RapI
 
−
PhrI RapI
 
−
* YdfI YdfH
 
−
RsbRD
 
−
YdiC YdiB
 
−
Gcp
 
−
TatCY TatAY
 
−
GroEL  GroES 
 
−
HrcA
 
−
PurQ PurS
 
−
PurL
 
−
PcrA YerB
 
−
* YxaL
 
−
YwhK
 
−
ComA RapH
 
−
Spo0F
 
−
CotJC CotJA
 
−
YesN YesM
 
−
YesS
 
−
YesP YesO
 
−
YesQ
 
−
*AcoB  AcoA 
 
−
AcoC
 
−
AcoL
 
−
PstC PstA delete
 
−
PstBA
 
−
PstBB
 
−
PstS
 
−
MntD MntC
 
−
MntA
 
−
MntB
 
−
FeuC  FeuB 
 
−
YusV
 
−
* FeuA
 
−
YfhA YfiZ
 
−
YusV
 
−
YfiY
 
−
YfiC YfiB
 
−
YfiK YfiJ
 
−
YfiM YfiL
 
−
YfiN
 
−
YhcG YhcE
 
−
YhcI YhcH
 
−
CspB
 
−
GlpK
 
−
* YhcZ YhcY
 
−
YteQ YtcP
 
−
YtcQ
 
−
MdxG  MdxF 
 
−
MdxE
 
−
MsmX
 
−
IseA LytF
 
−
[[MreBH]]
 
−
YhdK
 
−
YhdL
 
−
BmrD BmrC
 
−
YhaT YhaU
 
−
YhaP YhaQ
 
−
ScoC
 
−
EcsB EcsA
 
−
* PaiA AprE
 
−
MecA ComK
 
−
AddA AddB
 
−
YjbH
 
−
ThiG ThiS
 
−
CotY CotZ
 
−
CotV CotW
 
−
* ManP  ManR 
 
−
YkuN YjiB
 
−
YkuP
 
−
Mdh Ndh
 
−
PhrA RapA
 
−
Spo0F
 
−
ThiW ThiX
 
−
ThiV
 
−
ThiU
 
−
YkoH YkoG
 
−
NrgB TnrA
 
−
RsgI
 
−
* KtrC KtrD
 
−
KinE
 
−
Spo0E
 
−
KinD
 
−
MotA  MotB 
 
−
ClpP ClpE
 
−
GlcT
 
−
TreP
 
−
SacP
 
−
SacX
 
−
LicT
 
−
SacY
 
−
* SacT
 
−
LicR
 
−
LevR
 
−
RbsR
 
−
HprK
 
−
GamP
 
−
GmuA
 
−
LicA
 
−
LevD 
 
−
FruA
 
−
Sda KinA
 
−
* BioI YkuN
 
−
YkuP
 
−
DppC DppB
 
−
DppD
 
−
YkfD
 
−
DppE
 
−
OppC OppB
 
−
OppD
 
−
OppF
 
−
OppA
 
−
AppF  AppD 
 
−
AppB
 
−
AppC
 
−
AppA
 
−
GlnQ GlnP
 
−
GlnM
 
−
GlnH
 
−
TcyM TcyL
 
−
TcyJ
 
−
TcyK
 
−
TcyN
 
−
YurN  YurM 
 
−
YurJ
 
−
YurO
 
−
* OpuBD OpuBB
 
−
OpuBA
 
−
OpuBC
 
−
OpuCA OpuCB
 
−
OpuCC
 
−
OpuCD
 
−
TcyA TcyB
 
−
TcyC
 
−
ArtP ArtQ
 
−
ArtR
 
−
YxeM YxeN
 
−
YxeO
 
−
YckB Ycka
 
−
YknV YknU
 
−
YknZ  YknY 
 
−
* Mbl
 
−
KinC
 
−
RnjB
 
−
PfkA
 
−
PdhB PdhA
 
−
PdhC
 
−
PdhD
 
−
OdhA
 
−
OdhB
 
−
YlaD
 
−
Sco CtaC
 
−
RasP
 
−
* PrsA 
 
−
StoA SpoVD
 
−
SpoVE
 
−
FtsA
 
−
ZapA
 
−
EzrA
 
−
MciZ
 
−
SepF
 
−
SpoIIGA
 
−
MinC DivIVA
 
−
MinD
 
−
MinJ
 
−
RacA
 
−
* SpoIVA  SpoVM 
 
−
SpoVID
 
−
AcpA FapR
 
−
PlsY PlsX
 
−
BioI AcpA
 
−
ScpA Smc
 
−
ScpB
 
−
Ffh
 
−
Scr
 
−
SucC
 
−
SucD
 
−
RecA DprA
 
−
ClpY ClpQ
 
−
EpsE FliG
 
−
FlhA FliJ
 
−
FliT
 
−
* CheC CheY
 
−
CheA
 
−
FliD FlhA
 
−
Hag
 
−
FliS
 
−
McpB  CheA 
 
−
CheC
 
−
McpB
 
−
CheD
 
−
FlgM
 
−
RecU RecA
 
−
CotC CotE
 
−
CotU
 
−
EbrA EbrB
 
−
NrdF NrdE
 
−
GlnR
 
−
* CotC  CotU 
 
−
CitG
 
−
YngE YngH
 
−
Icd
 
−
PhrK RapK
 
−
SdpC CsaA
 
−
DesR DesK
 
−
OdhA OdhB
 
−
Icd
 
−
YplP
 
−
ThyB DfrA
 
−
EzrA UgtP
 
−
TrpB  TrpA 
 
−
CarB CarA
 
−
* SpoVID
 
−
SafA SpoIVA
 
−
Fer
 
−
RsiX
 
−
ResD ResE
 
−
ResB ResC
 
−
ScpA ScpB
 
−
RibE RibH
 
−
SpoIIAA
 
−
SpoIIP SpoIIM
 
−
BkdR
 
−
Spo0B
 
−
* BofC SpoIVB
 
−
AccA AccC
 
−
AccD
 
−
AccB
 
−
SpoIIQ  SpoIIIAH 
 
−
SpoIIIJ SpoIIIAE
 
−
SinI
 
−
SlrA
 
−
SlrR
 
−
PrsA PbpA
 
−
GlyQ GlyS
 
−
* DnaK DnaJ
 
−
SpoIID SpoIIP
 
−
KinB Sda
 
−
SpoIVFB
 
−
TrxA  ArsC 
 
−
DnaC YqaM
 
−
SpoIIIC
 
−
YrkP YrkQ
 
−
LevF LevG
 
−
LevE
 
−
LevR
 
−
LevD
 
−
RsiV
 
−
* SpoVID SafA
 
−
Spo0B
 
  
−
MinC MinD
+
==POTM 2018==
−
MinJ
+
<pubmed>    </pubmed>
−
MreD
 
−
Mbl
 
−
ClpP ClpX
 
−
SdhA SdhB 
 
−
SdhC
 
−
UvrB UvrC
 
−
* PheS PheT
 
−
OpuAA OpuAB
 
−
OpuAC
 
−
SsuA SsuC
 
−
SsuB
 
−
YtlC YtlD
 
−
YtlA
 
−
YvrA YvrB
 
−
YvrC
 
−
YcdH YceA
 
−
YcdI
 
−
YjkB YjkA
 
−
YvgM YvgL
 
−
AraN AraQ
 
−
AraP
 
−
MsmX
 
−
* LytS LytT
 
−
PhoP  PhoR 
 
−
CitZ
 
−
Icd
 
−
CitG
 
−
Pgm
 
−
AccD AccA
 
−
MotP MotS
 
−
YthP YthQ
 
−
* BceA BceB
 
−
BceR BceS
 
−
YtrB YtrF
 
−
YtrE
 
−
YtrC
 
−
YtrD
 
−
KtrB KtrA delete
 
−
KinB
 
−
PrsA PbpD
 
−
MalR MalK
 
−
MrpB MrpA
 
−
MrpC
 
−
MrpD
 
−
MrpE
 
−
MrpF
 
−
MrpG
 
−
* RapF ComA
 
−
ComP
 
−
RapD
 
−
RapK
 
−
DegS DegQ
 
−
IscU SufU
 
−
SufS
 
−
CssS CssR
 
−
LiaS LiaR
 
−
YvrG
 
−
YvrO YvrN
 
−
FhuB FhuC
 
−
FhuG
 
−
FhuD
 
−
YxeB
 
−
* CopZ CopA
 
−
SdpR SdpI
 
−
YkzW
 
−
YvfT YvfU
 
−
YvfR YvfS
 
−
RsbP RsbQ
 
−
AcoR
 
−
RocR
 
−
EpsA EpsB
 
−
SlrA SlrR
 
−
PsdB PsdA
 
−
PsdS PsdR
 
−
UvrB UvrA
 
−
* FtsE FtsX
 
−
FliD FliT
 
−
FliS
 
−
RsmY CsrA
 
−
RapG DegU
 
−
TagG  TagH 
 
−
CotG CotB
 
−
YwrA YwrB
 
−
TkmA
 
−
PtpZ
 
−
Ugd
 
−
* TuaD
 
−
Ssb
 
−
SsbB
 
−
Ldh
 
−
YvyG
 
−
YnfE
 
−
Asd
 
−
YorK
 
−
NrgB NrgA
 
−
RapB
 
−
* RbsD RbsC
 
−
RbsB
 
−
RbsA
 
−
RapE 
 
−
PhrE
 
−
AlbD AlbC
 
−
PhrF RapF
 
−
SacP SacT
 
−
SacX SacY
 
−
LicC
 
−
LicR
 
−
LicA
 
−
* YxlF YxlG
 
−
CydC CydD
 
−
YxjL YxjM
 
−
LicT
 
−
YxdL YxdM
 
−
YxdJ YxdK
 
−
YydI YydJ
 
−
YydH
 
−
* PhrG RapG
 
−
YycH YycI
 
−
WalR WalK
 
−
SsbA  DnaC 
 
−
YybJ YybL
 
−
YybK
 
−
ThdF GidA
 
−
RnpA
 
−
RnpB
 
−
GmuA GmuB
 
−
GmuC
 
−
MetN MetP
 
−
MetQ
 
−
* SbcC  --[[User:Jstuelk|Jstuelk]] 13:59, 23 July 2011 (CEST)
 
−
RecG
 
−
YrvE
 
−
YrvN SsbA
 
−
RecO
 
−
YqiB
 
−
Ung
 
−
YpbB
 
−
YrrC
 
−
YycH WalK
 
−
YycI
 
−
CheB CheA
 
−
CheV
 
−
Tkt Tpi
 
−
SpoIISB SpoIISA
 
−
Mfd
 
−
Soj Spo0J
 
−
BceS BceB
 
−
YirB YjbH
 
  
−
RsbRB  RsbT 
+
== für Master-Seminar ==
−
RsbRC
+
<pubmed>   24529384    20431016    24097941    22773139    21127214</pubmed>
−
RsbRD
 
−
GerAB GerAA delete
 
−
GerAC
 
−
MecA
 
−
ClpP
 
−
ComGB ComGA
 
−
ComFA
 
−
ComGC
 
−
ComGD
 
−
ComGE
 
−
ComGG
 
−
ComGC ComC delete
 
−
ComGD
 
−
ComGE
 
−
ComGG
 
−
ComGA ComEC delete
 
−
ComEA 
 
−
ComFA
 
−
CoiA
 
−
SsbB
 
−
DprA
 
−
RecA
 
−
CoiA SsbB
 
−
DprA
 
−
RecA
 
−
TasA TapA
 
−
UreC UreB
 
−
UreA
 
−
DivIVA Maf
 
−
FtsW
 
−
RuvB RuvA
 
−
RecU
 
−
GerAC Lgt
 
−
GerBC GerBA
 
−
GerBB
 
−
GerKC GerKB
 
−
GerKC
 
−
GerKA
 
−
fer des
 
−
ykuP
 
−
ykuN
 
−
Fra SufU
 
−
RnpA
 
−
CitT CitS
 
−
NdoA NdoAI
 
−
SpoIIQ SpoIIE
 
−
CymR CysK
 
−
PabA PabB
 
−
TrpE
 
−
McsA CtsR
 
−
McsB
 
−
ClpP
 
−
YpbH
 
−
MecA
 
−
RacA DisA
 
−
DnaB
 
−
PolC
 
−
HolA
 
−
HolB
 
−
DnaX
 
−
DnaG
 
−
DnaC
 
−
DnaI
 
−
PriA
 
−
SsbA
 
−
DnaE
 
−
 
 
−
==not yet in SubtiWiki==
 
−
<pubmed> 21636651</pubmed>
 
−
{{PubMed|}}
 
−
===sonst (nur Excel-Liste)===
 
−
 
 
−
==POTM==
 
−
<pubmed>21749987</pubmed>
 

Latest revision as of 10:09, 6 April 2020

  • strongly repressed in response to glucose starvation in M9 medium PubMed: hupA cycC

not yet in SubtiWiki

Nikolai P Radzinski, Marina Besprozvannaya, Eric L McLean, Anusha Talwalkar, Briana M Burton
DNA-Membrane Anchor Facilitates Efficient Chromosome Translocation at a Distance in Bacillus subtilis.
mBio: 2019, 10(3);
[PubMed:31239381] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Katherine R Hummels, Daniel B Kearns
Suppressor mutations in ribosomal proteins and FliY restore Bacillus subtilis swarming motility in the absence of EF-P.
PLoS Genet: 2019, 15(6);e1008179
[PubMed:31237868] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Bentley Shuster, Mark Khemmani, Yusei Nakaya, Gudrun Holland, Keito Iwamoto, Kimihiro Abe, Daisuke Imamura, Nina Maryn, Adam Driks, Tsutomu Sato, Patrick Eichenberger
Expansion of the Spore Surface Polysaccharide Layer in Bacillus subtilis by Deletion of Genes Encoding Glycosyltransferases and Glucose Modification Enzymes.
J Bacteriol: 2019, 201(19);
[PubMed:31235516] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Sofia Arnaouteli, D A Matoz-Fernandez, Michael Porter, Margarita Kalamara, James Abbott, Cait E MacPhee, Fordyce A Davidson, Nicola R Stanley-Wall
##Title##
Proc Natl Acad Sci U S A: 2019, 116(27);13553-13562
[PubMed:31217292] [WorldCat.org] [DOI] (I p)

Cameron V Sayer, Bidisha Barat, David L Popham
Identification of L-Valine-initiated-germination-active genes in Bacillus subtilis using Tn-seq.
PLoS One: 2019, 14(6);e0218220
[PubMed:31199835] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Seoungjun Lee, Ling Juan Wu, Jeff Errington
Microfluidic time-lapse analysis and reevaluation of the Bacillus subtilis cell cycle.
Microbiologyopen: 2019, 8(10);e876
[PubMed:31197963] [WorldCat.org] [DOI] (I p)

Emily E Brown, Allyssa K Miller, Inna V Krieger, Ryan M Otto, James C Sacchettini, Jennifer K Herman
##Title##
J Bacteriol: 2019, 201(16);
[PubMed:31160399] [WorldCat.org] [DOI] (I e)

Björn Richts, Jonathan Rosenberg, Fabian M Commichau
##Title##
Front Mol Biosci: 2019, 6;32
[PubMed:31134210] [WorldCat.org] [DOI] (P e)

Natalí B Rasetto, Antonela Lavatelli, Natalia Martin, María Cecilia Mansilla
Unravelling the lipoyl-relay of exogenous lipoate utilization in Bacillus subtilis.
Mol Microbiol: 2019, 112(1);302-316
[PubMed:31066113] [WorldCat.org] [DOI] (I p)


POTM 2018


für Master-Seminar