Difference between revisions of "Paper"

From SubtiWiki
Jump to: navigation, search
(→‎Daniel Reuß)
(→‎not yet in SubtiWiki)
 
(606 intermediate revisions by 5 users not shown)
Line 1: Line 1:
−
==Daniel Reuß==
+
* strongly repressed in response to glucose starvation in M9 medium {{PubMed|23033921}}: [[hupA]] [[cycC]]
−
Schmidl et al: PLOS Pathogens
 
−
<pubmed>21546586 10066529</pubmed>
 
  
−
* [[ManP]]  [[ManR]] 
+
==not yet in SubtiWiki==
−
[[YkuN]] [[YjiB]]
+
<pubmed>31239381  31237868
−
[[YkuP]] [[Ndh]]
+
  31235516
−
[[PhrA]] [[RapA]]
+
    31134210    31197963 31160399 31066113
−
[[ThiW]] [[ThiX]]
+
    31199835  31217292 </pubmed>
−
[[ThiV]]
 
−
[[ThiU]]
 
−
[[YkoH]] [[YkoG]]
 
−
[[NrgB]] [[TnrA]]
 
−
[[RsgI]]
 
−
* [[KtrC]] [[KtrD]]
 
−
[[KinE]]
 
−
[[Spo0E]]
 
−
[[KinD]]
 
−
[[MotA]]  [[MotB]] 
 
−
[[ClpP]] [[ClpE]]
 
−
[[TreP]]
 
−
* [[LicR]]
 
−
[[LevR]]
 
−
[[RbsR]]
 
−
[[HprK]]
 
−
[[GamP]]
 
−
[[GmuA]]
 
−
[[LicA]]
 
−
[[LevD]] 
 
−
[[FruA]]
 
−
[[Sda]] 
 
−
* [[BioI]] [[YkuN]]
 
−
[[YkuP]]
 
−
DppC DppB
 
−
DppD
 
−
YkfD
 
−
DppE
 
−
OppC OppB
 
−
OppD
 
−
OppF
 
−
OppA
 
−
AppF  AppD 
 
−
AppB
 
−
AppC
 
−
AppA
 
−
GlnQ GlnP
 
−
GlnM
 
−
GlnH
 
−
TcyM TcyL
 
−
TcyJ
 
−
TcyK
 
−
TcyN
 
−
YurN  YurM 
 
−
YurJ
 
−
YurO
 
−
* OpuBD OpuBB
 
−
OpuBA
 
−
OpuBC
 
−
OpuCA OpuCB
 
−
OpuCC
 
−
OpuCD
 
−
TcyA TcyB
 
−
TcyC
 
−
ArtP ArtQ
 
−
ArtR
 
−
YxeM YxeN
 
−
YxeO
 
−
YckB Ycka
 
−
YknV YknU
 
−
YknZ  YknY 
 
−
* Mbl
 
−
KinC
 
−
PdhB PdhA
 
−
PdhC
 
−
PdhD
 
−
OdhA
 
−
OdhB
 
−
YlaD
 
−
Sco CtaC
 
−
* 
 
−
StoA SpoVD
 
−
SpoVE
 
−
FtsA
 
−
ZapA
 
−
EzrA
 
−
MciZ
 
−
SepF
 
−
SpoIIGA
 
−
MinC DivIVA
 
−
MinD
 
−
MinJ
 
−
RacA
 
−
* SpoIVA  SpoVM 
 
−
SpoVID FapR
 
−
PlsY PlsX
 
−
BioI 
 
−
ScpA Smc
 
−
ScpB
 
−
Ffh
 
−
Scr
 
−
SucC
 
−
SucD
 
−
RecA DprA
 
−
ClpY ClpQ
 
−
EpsE FliG
 
−
FlhA FliJ
 
−
FliT
 
−
* CheC CheY
 
−
CheA
 
−
FliD FlhA
 
−
Hag
 
−
FliS
 
−
McpB  CheA 
 
−
CheC
 
−
McpB
 
−
CheD
 
−
FlgM
 
−
RecU RecA
 
−
CotC CotE
 
−
CotU
 
−
EbrA EbrB
 
−
NrdF NrdE
 
−
GlnR
 
−
* CotC  CotU 
 
−
CitG
 
−
YngE YngH
 
−
Icd
 
−
PhrK RapK
 
−
SdpC CsaA
 
−
DesR DesK
 
−
OdhA OdhB
 
−
Icd
 
−
YplP
 
−
ThyB DfrA
 
−
EzrA UgtP
 
−
TrpB  TrpA 
 
−
CarB CarA
 
−
* SpoVID
 
−
SafA SpoIVA
 
−
Fer
 
−
RsiX
 
−
ResD ResE
 
−
ResB ResC
 
−
ScpA ScpB
 
−
RibE RibH
 
−
SpoIIAA
 
−
SpoIIP SpoIIM
 
−
BkdR
 
−
Spo0B
 
−
* BofC 
 
−
AccA AccC
 
−
AccD
 
−
AccB
 
−
SpoIIQ  SpoIIIAH 
 
−
SpoIIIJ SpoIIIAE
 
−
SinI
 
−
SlrA
 
−
SlrR PbpA
 
−
GlyQ GlyS
 
−
* DnaK DnaJ
 
−
SpoIID SpoIIP
 
−
KinB Sda
 
−
SpoIVFB
 
−
TrxA  ArsC  YqaM
 
−
SpoIIIC
 
−
YrkP YrkQ
 
−
LevF LevG
 
−
LevE
 
−
LevR
 
−
LevD
 
−
RsiV
 
−
* SpoVID SafA
 
−
Spo0B
 
  
−
MinC MinD
+
==POTM 2018==
−
MinJ
+
<pubmed>    </pubmed>
−
MreD
 
−
Mbl
 
−
ClpP ClpX
 
−
SdhA SdhB 
 
−
SdhC
 
−
UvrB UvrC
 
−
* PheS PheT
 
−
OpuAA OpuAB
 
−
OpuAC
 
−
SsuA SsuC
 
−
SsuB
 
−
YtlC YtlD
 
−
YtlA
 
−
YvrA YvrB
 
−
YvrC
 
−
YcdH YceA
 
−
YcdI
 
−
YjkB YjkA
 
−
YvgM YvgL
 
−
AraN AraQ
 
−
AraP
 
−
* LytS LytT
 
−
PhoP  PhoR 
 
−
CitZ
 
−
Icd
 
−
CitG
 
−
AccD AccA
 
−
MotP MotS
 
−
YthP YthQ
 
−
* BceA BceB
 
−
BceR BceS
 
−
YtrB YtrF
 
−
YtrE
 
−
YtrC
 
−
YtrD
 
−
KtrB KtrA delete
 
−
KinB PbpD
 
−
MalR MalK
 
−
MrpB MrpA
 
−
MrpC
 
−
MrpD
 
−
MrpE
 
−
MrpF
 
−
MrpG
 
−
* RapF 
 
−
ComP
 
−
RapD
 
−
RapK
 
−
DegS DegQ
 
−
IscU SufU
 
−
SufS
 
−
CssS CssR
 
−
LiaS LiaR
 
−
YvrG
 
−
YvrO YvrN
 
−
FhuB FhuC
 
−
FhuG
 
−
FhuD
 
−
YxeB
 
−
* CopZ CopA
 
−
SdpR SdpI
 
−
YkzW
 
−
YvfT YvfU
 
−
YvfR YvfS  RsbQ
 
−
AcoR
 
−
RocR
 
−
EpsA EpsB
 
−
SlrA SlrR
 
−
PsdB PsdA
 
−
PsdS PsdR
 
−
UvrB 
 
−
* FtsE FtsX
 
−
FliD FliT
 
−
FliS
 
−
RsmY CsrA
 
−
RapG DegU
 
−
TagG  TagH 
 
−
CotG CotB
 
−
YwrA YwrB
 
−
TkmA
 
−
PtpZ
 
−
Ugd
 
−
* TuaD
 
−
Ssb
 
−
SsbB
 
−
Ldh
 
−
YvyG
 
−
YnfE
 
−
Asd
 
−
YorK
 
−
NrgB NrgA
 
−
RapB
 
−
* RbsD RbsC
 
−
RbsB
 
−
RbsA
 
−
RapE 
 
−
PhrE
 
−
AlbD AlbC
 
−
PhrF RapF
 
−
LicC
 
−
LicR
 
−
LicA
 
−
* YxlF YxlG
 
−
CydC CydD
 
−
YxjL YxjM
 
−
YxdL YxdM
 
−
YxdJ YxdK
 
−
YydI YydJ
 
−
YydH
 
−
* PhrG RapG
 
−
YycH YycI
 
−
WalR WalK   
 
−
YybJ YybL
 
−
YybK
 
−
ThdF GidA
 
−
RnpA
 
−
RnpB
 
−
GmuA GmuB
 
−
GmuC
 
−
MetN MetP
 
−
MetQ
 
−
* SbcC 
 
−
RecG
 
−
YrvE
 
−
YrvN 
 
−
RecO
 
−
YqiB
 
−
Ung
 
−
YpbB
 
−
YrrC
 
−
YycH WalK
 
−
YycI
 
−
CheB CheA
 
−
CheV
 
−
Tkt Tpi
 
−
SpoIISB SpoIISA
 
−
Soj Spo0J
 
−
BceS BceB
 
−
YirB
 
−
RsbRB   
 
−
RsbRC
 
−
GerAB GerAA
 
−
GerAC
 
−
ClpP
 
−
ComGB ComGA
 
−
ComFA
 
−
ComGC
 
−
ComGD
 
−
ComGE
 
−
ComGG
 
−
ComGC ComC
 
−
ComGD
 
−
ComGE
 
−
ComGG
 
−
ComGA ComEC
 
−
ComEA 
 
−
ComFA
 
−
CoiA
 
−
SsbB
 
−
DprA
 
−
RecA
 
−
CoiA SsbB
 
−
DprA
 
−
RecA
 
−
TasA TapA
 
−
UreC DivIVA Maf
 
−
FtsW
 
−
RuvB RuvA
 
−
RecU
 
−
GerAC Lgt
 
−
GerBC GerBA
 
−
GerBB
 
−
GerKC GerKB
 
−
GerKC
 
−
GerKA
 
−
fer des
 
−
ykuP
 
−
ykuN
 
−
Fra SufU
 
−
RnpA
 
−
CitT CitS
 
−
NdoA NdoAI
 
−
SpoIIQ SpoIIE
 
−
CymR CysK
 
−
PabA PabB
 
−
TrpE
 
−
McsA CtsR
 
−
McsB
 
−
ClpP
 
−
YpbH
 
−
RacA DisA
 
  
−
==not yet in SubtiWiki==
+
== für Master-Seminar ==
−
<pubmed> 21636651</pubmed>
+
<pubmed>   24529384    20431016    24097941    22773139    21127214</pubmed>
−
{{PubMed|}}
 
−
===sonst (nur Excel-Liste)===
 
−
 
 
−
==POTM==
 
−
* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21749987 Chi ''et al''.] demonstrate that S-bacillithiolation of the repressor [[OhrR]] and of four enzymes of the methionine biosynthesis pathway protects the ''B. subtilis'' cell against hypochlorite stress.
 
−
<pubmed>21749987</pubmed>
 
−
* '''Relevant ''Subti''Wiki pages:'''  [[Haike Antelmann]], [[Dörte Becher]], [[Ulrike Mäder]], [[resistance against oxidative and electrophile stress]], [[Spx regulon]], [[CtsR regulon]], [[PerR regulon]], [[OhrR]], [[MetE]], [[YxjG]], [[PpaC]], [[SerA]], [[YphP]]
 

Latest revision as of 10:09, 6 April 2020

  • strongly repressed in response to glucose starvation in M9 medium PubMed: hupA cycC

not yet in SubtiWiki


POTM 2018


für Master-Seminar

Laura Hobley, Sok Ho Kim, Yukari Maezato, Susan Wyllie, Alan H Fairlamb, Nicola R Stanley-Wall, Anthony J Michael
Norspermidine is not a self-produced trigger for biofilm disassembly.
Cell: 2014, 156(4);844-54
[PubMed:24529384] [WorldCat.org] [DOI] (I p)

Sara A Leiman, Janine M May, Matthew D Lebar, Daniel Kahne, Roberto Kolter, Richard Losick
D-amino acids indirectly inhibit biofilm formation in Bacillus subtilis by interfering with protein synthesis.
J Bacteriol: 2013, 195(23);5391-5
[PubMed:24097941] [WorldCat.org] [DOI] (I p)

Tobias J Erb, Patrick Kiefer, Bodo Hattendorf, Detlef Günther, Julia A Vorholt
GFAJ-1 is an arsenate-resistant, phosphate-dependent organism.
Science: 2012, 337(6093);467-70
[PubMed:22773139] [WorldCat.org] [DOI] (I p)

Felisa Wolfe-Simon, Jodi Switzer Blum, Thomas R Kulp, Gwyneth W Gordon, Shelley E Hoeft, Jennifer Pett-Ridge, John F Stolz, Samuel M Webb, Peter K Weber, Paul C W Davies, Ariel D Anbar, Ronald S Oremland
RETRACTED: A bacterium that can grow by using arsenic instead of phosphorus.
Science: 2011, 332(6034);1163-6
[PubMed:21127214] [WorldCat.org] [DOI] (I p)

Ilana Kolodkin-Gal, Diego Romero, Shugeng Cao, Jon Clardy, Roberto Kolter, Richard Losick
D-amino acids trigger biofilm disassembly.
Science: 2010, 328(5978);627-9
[PubMed:20431016] [WorldCat.org] [DOI] (I p)