Difference between revisions of "AlbF"

Revision as of 14:52, 8 August 2012

@@ Line 1: / Line 1: @@
-* '''Description:''' antilisterial bacteriocin (subtilosin) production <br/><br/>
+<a href=\"http://skachatmanual.pp.ua/?paged=8\">http://skachatmanual.pp.ua/?paged=8</a> <a href=\"http://skachatmanual.pp.ua/\">http://skachatmanual.pp.ua/</a> <a href=\"http://manualsa.ru/?paged=10\">http://manualsa.ru/?paged=10</a> <a href=\"http://manualsa.ru/\">http://manualsa.ru/</a> <a href=\"http://loadinstructions1.pp.ua/?paged=4\">http://loadinstructions1.pp.ua/?paged=4</a>  <a href=\"http://skachatmanual.pp.ua/?paged=2\">http://skachatmanual.pp.ua/?paged=2</a> <a href=\"http://manuals-ua.pp.ua/?paged=8\">http://manuals-ua.pp.ua/?paged=8</a> <a href=\"http://skachatmanual.pp.ua/?paged=4\">http://skachatmanual.pp.ua/?paged=4</a> <a href=\"http://manuals-ppua.pp.ua/?paged=2\">http://manuals-ppua.pp.ua/?paged=2</a> <a href=\"http://manualsa.ru/?paged=8\">http://manualsa.ru/?paged=8</a> <a href=\"http://manuals-acd.pp.ua/\">http://manuals-acd.pp.ua/</a> <a href=\"http://manuals-ua.pp.ua/?paged=2\">http://manuals-ua.pp.ua/?paged=2</a>  <a href=\"http://manuals-ppua.pp.ua/\">http://manuals-ppua.pp.ua/</a> <a href=\"http://manuals-pp.pp.ua/?paged=2\">http://manuals-pp.pp.ua/?paged=2</a>  <a href=\"http://manuals-acd.pp.ua/?paged=6\">http://manuals-acd.pp.ua/?paged=6</a> <a href=\"http://manualsa.ru/?paged=4\">http://manualsa.ru/?paged=4</a> <a href=\"http://loadinstructions1.pp.ua/?paged=8\">http://loadinstructions1.pp.ua/?paged=8</a> <a href=\"http://manualsa.ru/?paged=2\">http://manualsa.ru/?paged=2</a> <a href=\"http://manuals-pp.pp.ua/?paged=8\">http://manuals-pp.pp.ua/?paged=8</a> <a href=\"http://loadinstructions1.pp.ua/?paged=6\">http://loadinstructions1.pp.ua/?paged=6</a> <a href=\"http://manualsa.ru/?paged=6\">http://manualsa.ru/?paged=6</a>     <a href=\"http://manuals-pp.pp.ua/?paged=4\">http://manuals-pp.pp.ua/?paged=4</a>  <a href=\"http://skachatmanual.pp.ua/?paged=6\">http://skachatmanual.pp.ua/?paged=6</a>   <a href=\"http://manuals-pp.pp.ua/?paged=6\">http://manuals-pp.pp.ua/?paged=6</a>   <a href=\"http://manuals-acd.pp.ua/?paged=4\">http://manuals-acd.pp.ua/?paged=4</a>   <a href=\"http://manuals-ua.pp.ua/?paged=6\">http://manuals-ua.pp.ua/?paged=6</a>    <a href=\"http://manuals-acd.pp.ua/?paged=8\">http://manuals-acd.pp.ua/?paged=8</a>  <a href=\"http://manuals-acd.pp.ua/?paged=10\">http://manuals-acd.pp.ua/?paged=10</a>            <a href=\"http://manuals-ua.pp.ua/\">http://manuals-ua.pp.ua/</a>        <a href=\"http://loadinstructions1.pp.ua/?paged=10\">http://loadinstructions1.pp.ua/?paged=10</a>  <a href=\"http://skachatmanual.pp.ua/?paged=10\">http://skachatmanual.pp.ua/?paged=10</a>      <a href=\"http://loadinstructions1.pp.ua/?paged=2\">http://loadinstructions1.pp.ua/?paged=2</a>   <a href=\"http://manuals-ppua.pp.ua/?paged=8\">http://manuals-ppua.pp.ua/?paged=8</a> <a href=\"http://manuals-pp.pp.ua/?paged=10\">http://manuals-pp.pp.ua/?paged=10</a>          <a href=\"http://manuals-ppua.pp.ua/?paged=10\">http://manuals-ppua.pp.ua/?paged=10</a>       <a href=\"http://manuals-ua.pp.ua/?paged=10\">http://manuals-ua.pp.ua/?paged=10</a>
-{| align="right" border="1" cellpadding="2"
-|-
-|style="background:#ABCDEF;" align="center"|'''Gene name'''
-|''albF''
-|-
-|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Synonyms''' || ''ywhN ''
-|-
-|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Essential''' || no
-|-
-|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Product''' || unknown
-|-
-|style="background:#ABCDEF;" align="center"|'''Function''' || antilisterial bacteriocin (subtilosin) production
-|-
-|colspan="2" style="background:#FAF8CC;" align="center"| '''Gene expression levels in [http://cellpublisher.gobics.de/subtiexpress/ ''Subti''Express]''': [http://cellpublisher.gobics.de/subtiexpress/bsu/BSU37420 albF]
-|-
-|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''MW, pI''' || 48 kDa, 5.42
-|-
-|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Gene length, protein length''' || 1278 bp, 426 aa
-|-
-|style="background:#ABCDEF;" align="center"|'''Immediate neighbours''' || ''[[albE]]'', ''[[albG]]''
-|-
-|colspan="2" style="background:#FAF8CC;" align="center"|'''Get the DNA and protein [http://srs.ebi.ac.uk/srsbin/cgi-bin/wgetz?-e+&#91;EMBLCDS:CAB15769&#93;+-newId sequences] <br/> (Barbe ''et al.'', 2009)'''
-|-
-|colspan="2" | '''Genetic context''' <br/> [[Image:albF_context.gif]]
-  <div align="right"> <small>This image was kindly provided by [http://genolist.pasteur.fr/SubtiList/ SubtiList]</small></div>
-|-
-|colspan="2" |'''[http://genome.jouy.inra.fr/cgi-bin/seb/viewdetail.py?id=albF_3841017_3842297_1 Expression at a glance]'''&#160;&#160;&#160;{{PubMed|22383849}}<br/>[[Image:albF_expression.png|500px]]
-|-
-|}
-__TOC__
-<br/><br/><br/><br/>
-<br/><br/><br/><br/>
-<br/><br/><br/><br/>
-<br/><br/><br/><br/>
-<br/><br/><br/><br/>
-<br/><br/>
-= [[Categories]] containing this gene/protein =
-{{SubtiWiki category|[[miscellaneous metabolic pathways]]}},
-{{SubtiWiki category|[[biosynthesis of antibacterial compounds]]}}
-= This gene is a member of the following [[regulons]] =
-{{SubtiWiki regulon|[[AbrB regulon]]}},
-{{SubtiWiki regulon|[[ResD regulon]]}},
-{{SubtiWiki regulon|[[Rok regulon]]}}
-=The gene=
-=== Basic information ===
-* '''Locus tag:''' BSU37420
-===Phenotypes of a mutant ===
-=== Database entries ===
-* '''DBTBS entry:''' [http://dbtbs.hgc.jp/COG/prom/sboAX-albABCDEFG.html]
-* '''SubtiList entry:''' [http://genolist.pasteur.fr/SubtiList/genome.cgi?gene_detail+BG12466]
-=== Additional information===
-=The protein=
-=== Basic information/ Evolution ===
-* '''Catalyzed reaction/ biological activity:'''
-* '''Protein family:''' peptidase M16 family (according to Swiss-Prot)
-* '''Paralogous protein(s):'''
-=== Extended information on the protein ===
-* '''Kinetic information:'''
-* '''Domains:'''
-* '''Modification:'''
-* '''Cofactor(s):'''
-* '''Effectors of protein activity:'''
-* '''[[SubtInteract|Interactions]]:'''
-* '''[[Localization]]:'''
-=== Database entries ===
-* '''Structure:'''
-* '''UniProt:''' [http://www.uniprot.org/uniprot/P71006 P71006]
-* '''KEGG entry:''' [http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?bsu:BSU37420]
-* '''E.C. number:'''
-=== Additional information===
-=Expression and regulation=
-* '''Operon:''' ''[[sboA]]-[[sboX]]-[[albA]]-[[albB]]-[[albC]]-[[albD]]-[[albE]]-[[albF]]-[[albG]]'' {{PubMed|10572140}}
-* '''Expression browser:''' [http://genome.jouy.inra.fr/cgi-bin/seb/viewdetail.py?id=albF_3841017_3842297_1 albF] {{PubMed|22383849}}
-* '''Sigma factor:''' [[SigA]] {{PubMed|xxxxxx}} {{PubMed|10572140}}
-* '''Regulation:'''
-** repressed by [[Rok]] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/15743949 PubMed]
-** expressed under anaerobic conditions ([[ResD]]) [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/10809710 PubMed]
-** repressed during logrithmic growth ([[AbrB]]) [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/10572140,17720793 PubMed]
-* '''Regulatory mechanism:'''
-** [[Rok]]: transcription repression [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/15743949 PubMed]
-** [[ResD]]: transcription activation [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/10809710 PubMed]
-** [[AbrB]]:  transcription repression [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/10572140,17720793 PubMed]
-* '''Additional information:'''
-=Biological materials =
-* '''Mutant:'''
-* '''Expression vector:'''
-* '''lacZ fusion:'''
-* '''GFP fusion:'''
-* '''two-hybrid system:'''
-* '''Antibody:'''
-=Labs working on this gene/protein=
-=Your additional remarks=
-=References=
-<pubmed>10809709,10572140,,15743949,10809710,10572140,17720793, </pubmed>
-[[Category:Protein-coding genes]]

Difference between revisions of "AlbF"

Revision as of 14:52, 8 August 2012

Navigation menu

Personal tools

Namespaces

Variants

Views

More

Search

Navigation

Tools